資料介紹
基因組測序技術的快速發(fā)展使得生物數(shù)據(jù)庫中的基因和基因組序列數(shù)據(jù)數(shù)量迅速增加,但其中仍有大量基因功能是未知的。為此,提出基于異質網(wǎng)絡層次注意力機制的基因節(jié)點表示學習方法HAGE,用以預測基因功能。結合多種來源的數(shù)據(jù)集,構建一個具有節(jié)點屬性的基因功能相關異質網(wǎng)絡,在網(wǎng)絡中使用層次注意力機制為每一個基因節(jié)點學習一個節(jié)點嵌入向量,該向量可用于后續(xù)的基因功能預測等任務。實驗結果表明,與Graphsage和GAT等方法相比,HAGE具有更好的預測性能。
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