生物傳感器主要有下面三種分類命名方式。

（1）根據生物傳感器中分子識別元件即敏感元件可分為五類：酶傳感器（enzymesensor）、微生物傳感器（ microbialsensor）、細胞傳器（organallsensor）、組織傳感器（tis-suesensor）和免疫傳感器（immunolsensor）。顯而易見，所應用的敏感材料依次為酶、微生物個體、細胞器、動植物組織、抗原和抗體。

（2）根據生物傳感器的換能器即信號轉換器分類有：生物電極（bioelectrode）傳感器、半導體生物傳感器（ semiconductbiosensor）、光生物傳感器（opticalbiosensor）、熱生物傳感器（ calorimetricbiosensor）、壓電晶體生物傳感器（piezoelectricbiosensor）等，換能器依次為電化學電極、半導體、光電轉換器、熱敏電阻、壓電晶體等。

（3）以被測目標與分子識別元件的相互作用方式進行分類有生物親和型生物傳感器（ affinitybiosensor）、代謝型或催化型生物傳感 三種分類方法之間實際上互相交叉使用。